当受精卵在体外培养2~5天后，需要移植入子宫才能继续生长,发育。一般情况下，受精卵在体外培养48~72小时后进行胚胎移植，因为宫腔内的生长环境优于体外环境，更有利于胚胎生长。
为了便于胚胎移植，在移植手术当日，受术者要膀胱充盈，在腹部超声波下，膀胱像个“透声窗”，通过这个“窗”可以看到子宫及子宫内膜。实验室的医生将选择2~3个新鲜的可供移植的胚胎，轻轻吸入特殊的胚胎移植宫内。从实验室传给手术医生，手术医生将移植管经阴道,宫颈,轻轻插入宫腔内，放置到预先设定的位置。然后将含胚胎的液体，快速植入宫腔内，整个移植过程没有任何感觉。移植手术后，患者应该多卧床休息，特别是在胚胎移植后3~4天之内。这是移植入子宫的小胚胎并未着床，这些小胚胎将在宫腔内漂游3日后，选择一块最适宜的地方“安家”。在这一过程中，有些小胚胎可能会游入输卵管内，如果输卵管有慢性炎症，通而不畅，或者张力高，小胚胎进入后不能及时返回子宫，就可能发送宫外孕。宫外孕都发生在通而不畅的输卵管内。移植手术是整个过程中最后一关，是试管婴儿技术的重要因素之一，所以在顺利移植胚胎后还要按医生的要求休息好，坚持黄体支持治疗，放松心情提供成功率。
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